Георгиевский кавалер, сопредседатель Общероссийского общественного гражданско-патриотического движения «Бессмертный полк России», член Рабочей группы Общественной палаты по реализации Всероссийского проекта «Эстафета поколений».
С.А. Макаров родился 19 сентября 1952 года в поселке Николаевка Еврейской автономной области.
В 1974 году окончил Благовещенское высшее танковое командное училище имени Маршала Советского Союза К.А. Мерецкова. Служил командиром танкового взвода, роты в Дальневосточном военном округе, командиром роты, начальником штаба и командиром танкового батальона в Группе советских войск в Германии.
В 1987 году С.А.Макаров закончил Военную академию бронетанковых войск имени Маршала Советского Союза Р.Я. Малиновского и был назначен начальником штаба - заместителем командира танкового полка, командиром учебного танкового полка, командиром 135-й отдельной мотострелковой бригады, заместителем командующего 58-й армией в Северо-Кавказский военный округ.
В 1998 году окончил Военную академию Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации. Был назначен начальником штаба Первым заместителем командующего армией Ленинградского округа. Позднее назначен заместителем руководителя оперативного штаба МВД России по Северному Кавказу от Министерства обороны РФ, где прослужил в течение двух лет.
С 2000 по 2002 год являлся командующим 20-й гвардейской армией в Московском военном округе. В течение трех лет служил заместителем командующего войсками Северо-Кавказского военного округа, командующим объединенной группировкой войск по проведению контртеррористических операций на территории Северо-Кавказского региона.
В 2003 году С.А. Макарову присвоено воинское звание генерал-полковника.В 2004 году назначен начальником штаба - первым заместителем командующего войсками Приволжско-Уральского военного округа.
С 26 мая 2008 года по 11 января 2010 года назначен Командующим войсками Северо-Кавказского военного округа.
18 августа 2008 года за успешное проведение операции в зоне конфликта в Южной Осетии стал первым кавалером ордена Святого Георгия IV степени.
Имеет ряд других заслуженных наград: орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени с изображением мечей; орден «За военные заслуги»; орден «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» III степени; медали СССР; медали РФ.
С 2013 по 2016 начальник Военной академии Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации.
С 2016 года главный инспектор Военного учебно-научного центра Сухопутных войск «Общевойсковая академия Вооруженных Сил Российской Федерации»
В 2018 году был избран сопредседателем Общероссийского общественного гражданско-патриотического движения «Бессмертный полк России».